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O Santuário Nacional Lagunas de Mejía se estabeleceram em 24 fevereiro de 1984, por meio de Ordenação Suprema Nº 015-84-AG.

Fica situado no departamento de Arequipa, município de Islay. Tem uma superfície de 690,6 hectares.
É um refúgio e lugar de descanso para os pássaros migratórios em mais de 2 000 km da costa do Pacífico. Provê o hábitat e comida necessária, principalmente para os pássaros que vêm do hemisfério norte, como o playero blanco (Calidris alba).

Nos bancos das lagunas está o sapo (Bufo limensis), enquanto nas colinas perto de praias são observados lagartos pequenos, como Microlophus tigris das áreas mais altas desce a raposa litoral (Pseudolapex sechurae). Registraram-se espécies de peixes como a Lisa (Mugil cephalus) e o pejerrey (Basilichthys sp.).

Quanto os pássaros, existem 180 espécies aproximadamente na área da praia, entre migratórios e residentes. Eles podem ser observados: gaivota cinza (Larus modestus), playero branco (Calidris alba) , rayador (Rinchops niger), gaivota peruana (Larus belcheri), gaivota Dominicana (Larus dominicanus) e gaivota de capuz cinza (Larus cirrocephalus).

Nas lagunas são também outros pássaros como o zambullidor pimpollo (Rollandia rolland), o zambullidor grande (Podiceps principal), o pato sutro (Anas flavirostris), o pato gargantillo (Ells bahamensis), o pato vermelho (Ells cyanoptera), a polla de água (Gallinula chloropus), a choca (Fulica americana), o gallineta comum (Rallus limicola), a garça cuca (Ardea cocoi), a garça branca grande (Egretta alba), a garça branca pequena (Egretta thula) e a garça azul (Hydranassa caerulea). As parihuanas (Phoenicopterus chilensis) eles têm preferência pelas áreas de pouca vegetação.
A vegetação dominante é o junco (Scirpus sp.), a totora (Typha sp.) e os gramadais associados com Salicornia fructicosa.

Dentro da água das lagunas são algas do gênero Chara sp.
Entre os objetivos do Santuário Nacional de lagõas de Mejía que são: proteger a avifauna residente em perigo de extinção, como também as espécies migratórias; conservar o refúgio dos pássaros migratórios nas rotas Norte-sul; preservar o hábitat para espécies endêmicas em perigo de extinção; manter associações importantes de característica de flora selvagem dos ecossistemas aquáticos da costa e promover o desenvolvimento econômico da região por meio do desenvolvimento da atividade turística.