A Tarapoto come nella maggior parte delle città di San Martin, le strade sono piene di motociclette. Per questo motivo la scelta migliore per spostarsi da un posto all'altro è il mototaxi, un efficiente ed economico - anche se non molto comodo - servizio di trasporto.

I mototaxi si trovano in tutte le strade e La possono portala in tutti i luoghi turistici nelle vicinanze della città. Si consiglia di pattuire il prezzo prima di salire sul veicolo.

Per arrivare alla spiaggia di Cumbaza, a 5 chilometri da Tarapoto - si può prendere un autobus della tratta Tarapoto-Morales o i veicoli del comitato di Taxi, la cui fermata si trova al primo isolato del Jirón San Martin.

Al Lago Azul, nel distretto El Sauce, a due ora da Tarapoto, si può arrivare per via aerea, sempre se la pista di atterraggio sia in buone condizioni e non nel periodo di piogge. Il volo dura all'incirca 10 minuti.