Per arrivare da Choquequirao è raccomandabile iniziare la strada da Cusco, "l'ombelico" del mondo andino che dura approssimativamente 6 ore. A Cusco si arriva in un volo di 1 ora da Lima, o via terra dietro un lungo periplo di 24 ore.

Dalla chiamata "Città Imperiale", bisogna mobilitarsi in autobus o camioncino al paese di Cachora (Apurímac). In questa piccola comunità andina, incomincia la camminata di 60 chilometri, andata e ritorno, che può intercalarsi con tratti a cavallo o mula.