La Zona Reservada de Güeppí se estableció el 3 de abril de 1997, mediante Decreto Supremo Nº 003-97-AG. Se encuentra ubicada en el departamento de Loreto, provincia de Maynas. Tiene una extensión de 625 971 hectáreas.

El ecosistema más importante de la zona lo constituyen las masas de agua del conjunto Aguas Negras, con formaciones de vegetación acuática flotante y herbácea pantanosa.

Entre las especies de fauna conocida, en situación vulnerable o en vías de extinción, podemos encontrar el otorongo (Panthera onça), el lobo de río (Pteronura brasiliensis), el caimán (Caiman crocodilus), el manatí (Trichechus inunguis), el bufeo colorado (Inia geoffrensis) y el bufeo gris (Sotalia fluviatilis), entre otras.

Existe asimismo una alta densidad de aves y reptiles, entre estos últimos principalmente el lagarto negro (Melanosuchus niger). En el río Lagartococha, fronterizo con Ecuador, se encuentra, una alta densidad de paiche (Arapaima gigas), presentando un área de distribución rara debido al aislamiento.

Es importante también mencionar que en este sector se han encontrado restos arqueológicos de culturas preincaicas que nos pueden proporcionar valiosos datos sobre la ocupación humana de esta zona. En la actualidad esta región es habitada por las comunidades nativas Kichwas, Secoyas y Boras.

Entre los principales objetivos de la Zona Reservada de Güeppí está el de proteger las áreas naturales del bosque muy húmedo Tropical, pues forman parte de los refugios del Pleistoceno o centros de gran endemismo y evolución.

Específicamente, el límite sur del área coincide con el refugio y centro de evolución del Napo. Además se busca conservar la flora y fauna en situación vulnerable o en vías de extinción; promover la investigación científica, ya que los refugios del Pleistoceno presentan gran diversidad de formas de vida; y promover el turismo, la recreación y otras actividades para la conservación y manejo sostenible de los recursos, involucrando a las poblaciones aledañas, tanto colonas como nativas, para contribuir a mejorar su nivel socioeconómico.