En Tarapoto como en las demás ciudades de San Martín, las calles están repletas de motocicletas. Por eso, la mejor opción para trasladarse de un lugar a otro, es el mototaxi, un eficiente y económico -aunque no muy cómodo- servicio de transporte.

Los mototaxis se encuentran en toda las calles y lo pueden transportar a los atractivos turísticos aledaños a la ciudad. Se recomienda pactar el monto del servicio antes de subir al vehículo.

Para llegar al balneario de Cumbaza -a 5 kilómetros de Tarapoto- se puede abordar un ómnibus de la ruta Tarapoto-Morales o los vehículos del Comité de Taxis, cuyo paradero se encuentra en la primera cuadra del Jirón San Martín.

A la laguna Azul, en el distrito El Sauce, a dos horas de Tarapoto, se puede llegar por vía aérea, siempre y cuando la pista de aterrizaje se encuentre en buenas condiciones y no sea época de lluvias. El vuelo dura cerca de 10 minutos.