Iquitos, por sus características climáticas, es la ciudad de las motocicletas. Por ello, el mototaxi es la forma más común para trasladarse de un lugar a otro.

El mototaxi, un vehículo bastante ligero similar a una motocicleta, tiene un habitáculo en la parte posterior para dos o tres pasajeros. Las tarifas de este servicio son fijadas antes de subir.

Para movilizarse dentro del perímetro de la ciudad, el visitante puede optar por el transporte público, servicio ofrecido por buses y minibuses que siguen una ruta determinada.

Si el objetivo es recorrer el Amazonas lo ideal es acercarse a las empresas de turismo de la ciudad, que ofrecen diversos servicios ecoturísticos, que se ajustan al presupuesto, al tiempo disponible y a la capacidad física del visitante.