In kleinen Städten wie Puerto Maldonado ist es sehr einfach sich zu Fuss fortzubewegen.
Es gibt aber auch Mototaxis zu günstigen Tarifen, um in die verschiedenen Sektoren der Stadt zu gelangen.

Um Ausflüge in die Naturschutzgebiete und Nationalparks zu machen, muss man auf das Service einer Reiseagentur zurückgreifen. Ein derartiges Service inkluiert normalerweise die Transfers im Boot, den Aufenthalt in einer Lodge, Verpflegung und geführte Touren.