Die beste Zeit um nach Cusco zu reisen ist von Juni bis Oktober. Während dieser Monate scheint die Sonne den ganzen Tag über, im Schatten kann es aber etwas kühl sein. Man sollte daher auch immer eine Jacke dabei haben.

In den Nächten kann die Temperatur auf 10°C sinken. Während der Monate von Dezember bis April ist Regenzeit mit strömenden Regen. Generell ist das Klima in Cusco hart, aber nicht eisig kalt. Die Jahresdurchschnittstemperatur beträgt 12°C, am Morgen liegt die Durchschnittstemperatur bei 18°C und in der Nacht bei 6°C.

Ein weiterer Grund um Cusco im Juni zu bereisen, ist das Inti Raymi oder Sonnenfest, welches während der Inkazeit eine der wichtigsten Zeremonien war. Der herrschende Inka verehrt und betet die Sonne an, um eine reiche Ernte zu haben und um den Hunger vom Reich fernzuhalten.