Von Lima kann man in gut 70 Minuten nach Cusco fliegen. Es gibt zwei Fluglinien, die Cusco anfliegen: Lan Peru

Flüge von Lima nach Cusco bzw. Cusco nach Lima: Lan Peru: tägliche Flüge

Am Flughafen von Cusco kommen auch internationale Flüge an.
Lloyd Aéro Boliviano (LAB), Flüge jeden Dienstag, Donnerstag und Samstag, mit Anschlussflügen in Bolivien nach Cochabamba und Santa Cruz.

Es wird empfohlen die Reservierungen und Abflugzeiten rückbestätigen zu lassen.

Man kann Cusco auch über Land erreichen; die Fahrt ist allerdings sehr anstrengend und dauert ungefähr 1 ½ Tage.

Von Lima aus gibt es folgende Routen:

- Route: Lima – Cusco - Juliaca - Cusco
- Route: Lima - Nazca - Puquio - Chalhuanca - Abancay - Cusco
- Route: Lima - Huancayo - Ayacucho - Abancay - Cusco

Die Fahrt über Land ist nicht sehr empfehlenswert, es ist besser nach Cusco zu fliegen.