Le Sanctuaire National Megantoni fut établi grâce au Décret Suprême N° 030-2004-AG du 18 août 2004. Sa superficie atteint les 215 868.96 hectares et il est situé dans la partie centrale du bassin de la rivière Urubamba, dans la Cordillère d'Ausangate, district d'Echarate, province de La Convencion (Département de Cusco).
Cette zone est une des seules où la végétation reste intacte et qui permet de connecter la région de la puna avec la forêt basse. Cette zone ne contient pas uniquement une richesse impressionnante d'espèces uniques et restreintes à son rang latitudinaire, elle sert également de corridor permanent pour la faune, plus particulièrement maintenant que les changements de climats et la déforestation affectent l'habitat de nombreuses espèces.
La Zone Réservée de Megantoni possède une végétation assez variée dont une grande diversité d'orchidées, qui sont présentes dans la quasi-totalité des zones étudiées. La grande diversité est probablement la conséquence du grand nombre d'habitats présents dans la région (10 zones de vie).
La faune du sanctuaire est également assez variée. Plusieurs espèces d'oiseaux ont été observées, ainsi que des espèces nouvelles et uniques de crapauds et de petits lézards. De plus, sur les 32 espèces de mammifères rencontrés dans la Zone Réservée de Megantoni, 5 se trouvent en danger d'extinction et 12 sont potentiellement menacées.
Le relief de cette réserve naturelle est principalement composé de collines et de montagnes avec des altitudes allant de 416 à 3 960 mètres, créant ainsi une variété d'étages altitudinaires et climatiques qui ont permis l'existence de dix zones de vie. Le Pongo de Mainique fait aussi partie du sanctuaire, qui compte plus de 30 cataractes de chaque coté de la rivière Urubamba.
Le Pongo Mainique a une signification assez importante pour les cultures Machiguenga et Yine Yami, des bassins de la rivière Urubamba. Cela est dû au fait que les légendes sur les origines de leurs ancêtres, ainsi que sur différents aspects de la vie, sont liées aux sources d'eau de ce lieu. Des voyageurs et aventuriers arrivent jusque là, mais surtout des guérisseurs Machiguenga, compte tenu que l'on raconte qu'à l'intérieur des roches des montagnes vivent les gardiens de la nature (esprits de la nature), qui révèlent leur savoir et connaissances des plantes médicinales aux guérisseurs.
L'objectif principal du Sanctuaire National Megantoni est de conserver
de façon intangible des écosystèmes qui se sont développés dans les
Montagnes Megantoni et qui protègent des forêts intactes, des sources
d'eau comme les sources des rivières Tambia et Ticumpinia, de grande
valeur culturelle et biologique.