Le Parc National Bahuaja - Sonene a été établi le 17 juillet 1996 au moyen de l'Ordonnance Suprême Nº 012 - 96 - AG.

Il a été créé suite à la classification territoriale menée avec l'active participation d'organisations corporatives et sociales, autorités, spécialistes et communautés locales de Madre Dios et Puno.
Ce Parc National est localisé dans le départements de Madre Dios et Puno, dans les provinces de Tambopata et Sandia, respectivement. Il a une surface de 537 053,25 hectares qui correspond à ce qui était le Sanctuaire National Pampas de Heath et une partie de la Zone Réservée Tambopata-Candamo. Son nom, en langue Ese'eja, est celui des rivières dont les cuvettes protègent le Tambopata et Heath. Il possède une zone frontalière avec le Parc National Madidi en Bolivie.
Ce Parc héberge des populations intactes de plusieurs espèces de faune sauvage menacées comme la loutre géante ou loup de rivière (brasiliensis Pteronura), le chien de montagne (venaticus Speothos), le caïman noir (niger Melanosuchus) et l'aigle Harpie (harpyja Harpia).
Comme dans la Zone Réservée de Tambopata-Candamo, Il existe une grande diversité d'oiseaux et insectes comme des papillons, des libellules et des fourmis arboricoles. Il protège aussi le seul échantillon existant au Pérou des dénommées pampas ou savanes humides tropicales et les espèces représentatives de faune sauvage qui se trouvent dans cet écosystème: le cerf des marais (dichotomus Blastocerus) et le loup à crinière (brachyurus Chrysocyon), qui n'existent pas dans d'autres endroits du pays.
La rivière de Heath et ses pampas sont un écosystème unique au Pérou. Cette rivière ne permet pas uniquement l'accès aux Pampas célèbres de Heath, mais elle inclut également une grande étendue de terrasses argileuses qui paraissent être associées aux colpas d'aras et autres animaux. Les pampas, avec 8 000 hectares environ, sont des pâturages inondés périodiquement qui se régénèrent grâce aux feux occasionnels durant la saison sèche.
L'origine et âge des pampas sont inconnus, mais leur futur est associé aux feux périodiques. Les pâturages qui se régénèrent dans les pampas non consommées par le feu, sont de courte durée.
Parmi les objectifs principaux du Parc National Bahuaja-Sonene on trouve la conservation des paysages de la forêt du sud et la protection du seul échantillon existant au Pérou de savanes humides tropicales et leur flore et faune sauvage, particulièrement le cerf des marais et le loup de la crinière.